직지사에는 여러 전각이 있는데, 대웅전, 관음전 , 비로전 , 설법전 , 사명각 , 청풍료 , 명부전을 차례로 살펴 보았다.
고구려의 아도 (阿道 )가 지었다는 설이 있으나 현재 사적비 (寺蹟碑 )가 허물어져 확실한 것은 알 수 없고 , 418 년 (눌지왕 2년)에 묵호자 (墨胡子 )가 경북 구미시에 있는 도리사 (桃李寺 )와 함께 창건했다고 전한다 .
그 후 645 년(선덕여왕 14년)에 자장 (慈藏 )이 , 930 년(경순왕 4년)에는 천묵 (天默 )이 중수하고 , 936 년 (태조 19년)에 능여 (能如 )가 고려 태조의 도움을 받아 중건하였는데 , 임진왜란 때 불에 거의 타버려 1610 년(광해군 2년)에 복구에 들어가 60여 년 후 작업을 끝맺었다.
직지사라는 절 이름은 능여가 절터를 잴 때 자를 쓰지 않고 직접 자기 손으로 측량한 데서 붙여졌다고 한다 . 조선시대에 학조 (學祖 )가 주지로 있었고 , 유정 (惟政 )이 여기서 승려가 되었다.
경내에는 석조약사여래좌상 (보물 319호), 대웅전 앞 3층 석탑(보물 606호), 비로전 앞 3층 석탑 (보물 607호), 대웅전 삼존불 탱화 3폭 (보물 670호), 청풍료 (淸風寮 )앞 3층석탑 (보물 1186호) 등의 문화재가 있다 .